Nhà phát triển chính của Assassin Creed Shadows đảm bảo cho người chơi rằng việc tập trung vào một nhân vật chính sẽ không ảnh hưởng đáng kể đến trải nghiệm chung của họ. Trò chơi có hai nhân vật có thể chơi được: Naoe, một nữ Shinobi và Yasuke, một Samurai châu Phi lịch sử, người đã đưa ra cuộc thảo luận trước khi phát hành.
Những lo ngại phát sinh rằng ưu tiên một nhân vật có thể dẫn đến các yếu tố câu chuyện bị bỏ lỡ hoặc trò chơi. Giám đốc sáng tạo Jonathan Dumont đã giải quyết những mối quan tâm này, mô tả cách tiếp cận cân bằng của riêng mình: ông thường chơi 3-5 giờ với một nhân vật, sau đó chuyển sang người kia trong 2-3 giờ.
Tuy nhiên, Dumont làm rõ rằng người chơi sẽ không gặp bất lợi đáng kể bằng cách ủng hộ một nhân vật. Trong khi mỗi nhân vật chính tự hào có các chuỗi mở đầu và cốt truyện cá nhân độc đáo, thì câu chuyện của trò chơi thích nghi với sự lựa chọn của người chơi. Ông khuyến khích người chơi làm theo sở thích của họ: "Trải nghiệm cốt lõi là linh hoạt. Chọn yêu thích của bạn; câu chuyện sẽ điều chỉnh." Về cơ bản, trong khi các vòng cung nhân vật cá nhân tồn tại, cốt truyện chính vẫn có thể truy cập được bất kể người chơi nhân vật nào chủ yếu sử dụng.
