Główny programista Assassin's Creed Shadows zapewnia graczy, że skupienie się na jednym bohaterze nie wpłynie znacząco na ich ogólne doświadczenie. Gra zawiera dwie grywalne postacie: Naoe, shinobi i Yasuke, historyczne afrykańskie samurajskie, których włączenie wywołało dyskusję przedpremierową.
Powstały obawy, że ustalanie priorytetów jednej postaci może prowadzić do pominięcia elementów lub rozgrywki. Dyrektor kreatywny Jonathan Dumont zajął się tymi obawami, opisując własne zrównoważone podejście: zwykle gra 3-5 godzin z jedną postacią, a następnie przechodzi na drugą na 2-3 godziny.
Jednak Dumont wyjaśnił, że gracze nie będą w znacznej niekorzystnej sytuacji, faworyzując jedną postać. Podczas gdy każdy bohater ma unikalne sekwencje otwierające i osobiste historie, narracja gry dostosowuje się do wyboru gracza. Zachęca graczy do przestrzegania swoich preferencji: „Podstawowe doświadczenie jest elastyczne. Wybierz swój ulubiony; narracja się dostosuje”. Zasadniczo, chociaż istnieją poszczególne łuki postaci, główna historia pozostaje dostępna niezależnie od tego, jakiego przede wszystkim wykorzystają gracze postaci.